豬的全基因組范圍內(nèi)Fox轉(zhuǎn)錄因子家族的識(shí)別和進(jìn)化分析

Fox蛋白是一類在后口生物界中廣泛存在的轉(zhuǎn)錄因子,屬于"螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋"(helix-turn-helix)類蛋白的一個(gè)亞群.我們對(duì)其進(jìn)行了全基因組的分析,探討了此基因家族的分類.從豬中共識(shí)別27個(gè)含有Fox結(jié)構(gòu)域的基因.通過利用Fox結(jié)構(gòu)域內(nèi)的氨基酸序列構(gòu)建了NJ進(jìn)化樹,結(jié)果表明,27條基因內(nèi)有20條分別歸屬到9個(gè)Fox基因家族中.本研究發(fā)現(xiàn)Fox基因在染色體上的分布呈不均衡性且存在3個(gè)基因簇.另外通過基因重復(fù)使得Fox基因家族得以擴(kuò)增.基于人類Fox基因的研究結(jié)果,也討論了豬Fox基因家族的功能分化和保守性.

作 者： 宮磊 王志鵬 高會(huì)江 GONG Lei WANG Zhi-peng GAO Hui-jiang   作者單位： 宮磊,王志鵬,GONG Lei,WANG Zhi-peng(東北農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,黑龍江,哈爾濱,150030)

高會(huì)江,GAO Hui-jiang(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院,北京畜牧獸醫(yī)研究所,北京,100193) 

刊 名： 黑龍江動(dòng)物繁殖  英文刊名： HEILONGJIANG JOURNAL OF ANIMAL REPRODUCTION  年，卷(期)： 2010 18(3)  分類號(hào)： S828.3  關(guān)鍵詞： Fox轉(zhuǎn)錄因子   豬   全基因組   系統(tǒng)發(fā)育分析  

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