三種鱉線粒體DNA細胞色素b基因序列的比較分析

對中華鱉、砂鱉和山瑞鱉線粒體DNA細胞色素b基因進行了引物設計、PCR擴增、序列測定和PCR-PFLP(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism)分析.研究結果表明中華鱉、砂鱉與山瑞鱉線粒體DNA Cytb基因的序列全長相同,均為1140bp,其A、C、G、T含量相似,分別為378個(33.2%)、322個(28.2%)、122個(10.7%)、318個(27.9%)、373個(32.7%)、324個(28.4%)、124個(10.9%)、319個(28.0%)、380個(33.3%)、330個(28.9%)、127個(11.1%)、303個(26.7%).同源性及序列差異率分析表明:中華鱉與砂鱉b基因序列的同源性為92.3%,中華鱉、山瑞鱉的為85.0%,砂鱉、山瑞鱉的為84.1%;中華鱉與砂鱉b基因核苷酸序列間的差異率為7.7%,中華鱉、山瑞鱉間的序列差異率為15.0%,砂鱉、山瑞鱉間的序列差異率為15.9%,而中華鱉、砂鱉、山瑞鱉各自個體間的序列差異率分別為2.37%、0.88%和0.18%,種間差異顯著.用內切酶酶切分析其擴增產(chǎn)物,結果表明:用內切酶Nde Ⅰ可準確鑒別砂鱉,而用內切酶BamHⅠ則可準確鑒別山瑞鱉.內切酶NdeⅠ和BamHⅠ的聯(lián)用分析,可使這三種鱉在分子水平都得到明確的鑒定.從三種鱉線粒體DNA Cytb基因核苷酸序列的顯著差異和酶切位點的變化,可以進一步證明砂鱉是不同于中華鱉的鱉屬一新種.

作 者： 陳合格 劉文彬 李建中 張軒杰 CHEN He-Ge LIU Wen-Bin LI Jian-Zhong ZHANG Xuan-Jie   作者單位： 湖南師范大學生命科學學院,長沙,410081  刊 名： 水生生物學報  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA HYDROBIOLOGICA SINICA  年，卷(期)： 2006 30(4)  分類號： Q173  關鍵詞： 中華鱉   砂鱉   山瑞鱉   細胞色素b   PCR-RFLP分析   分子鑒定標記  

【三種鱉線粒體DNA細胞色素b基因序列的比較分析】相關文章：

絨螯蟹線粒體細胞色素b基因的RFLP分析04-26

從細胞色素b基因序列探討普氏野馬與蒙古馬的遺傳多態(tài)性04-27

猛禽和夜鷹類的線粒體DNA序列比較和分子進化關系的研究04-26

大鰭(魚矞)基于細胞色素b基因序列的遺傳變異及生物地理過程04-26

番鴨呼腸孤病毒σB和σNS基因克隆及序列分析04-27

枸杞線粒體DNA的提取04-26

豬色素上皮衍生因子的電子克隆及序列分析04-26

人溶菌酶基因cDNA的克隆和序列分析04-26

褐飛虱細胞色素P450基因cDNA片段的克隆、測序及表達分析04-26

蝦夷扇貝β-actin基因的克隆和序列分析04-26