植物查爾酮異構(gòu)酶的生物信息學(xué)分析

采用生物信息學(xué)方法和工具對(duì)GenBank中的洋蔥、豌豆、番茄和茶等植物的黃酮類(lèi)化合物合成關(guān)鍵酶查爾酮異構(gòu)酶(CHI)的核酸和氨基酸序列進(jìn)行了比對(duì)、分析和建模,進(jìn)而對(duì)其分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)、亞細(xì)胞定位、蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)肽、跨膜結(jié)構(gòu)域、疏水性、分子系統(tǒng)進(jìn)化、蛋白質(zhì)二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)等重要參數(shù)進(jìn)行了預(yù)測(cè)和推理.結(jié)果表明:該類(lèi)酶基因的全長(zhǎng)包括5'、3'非翻譯區(qū)和一個(gè)開(kāi)放閱讀框,無(wú)蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)肽,且定位于細(xì)胞質(zhì)基質(zhì),是一個(gè)疏水性蛋白,二級(jí)結(jié)構(gòu)均以隨機(jī)卷曲和α-螺旋為主要構(gòu)件,洋蔥和豌豆的CHI三維建模成功.

作 者： 雷桅 鄒祥 向陽(yáng) 湯紹虎 孫敏 LEI Wei ZOU Xiang XIANG Yang TANG Shao-hu SUN Min   作者單位： 雷桅,向陽(yáng),湯紹虎,孫敏,LEI Wei,XIANG Yang,TANG Shao-hu,SUN Min(西南大學(xué),生命科學(xué)學(xué)院,三峽庫(kù)區(qū)生態(tài)環(huán)境教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,重慶,400715)

鄒祥,ZOU Xiang(西南大學(xué)藥學(xué)院,重慶,400715) 

刊 名： 北方園藝  PKU 英文刊名： NORTHERN HORTICULTURE  年，卷(期)： 2008 ""(2)  分類(lèi)號(hào)： Q946.5 Q558  關(guān)鍵詞： 查爾酮異構(gòu)酶   生物信息學(xué)   黃酮類(lèi)化合物  

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