環(huán)境微生物群落分析的T-RFLP技術及其優(yōu)化措施

末端限制性酶切片段長度多態(tài)性分析(terminal restriction fragment length polymorphism, T-RFLP)是近年來發(fā)展起來的、不依賴于培養(yǎng)的微生物群落分析方法之一.由于其在微生物群落結構分析方面的特點,包括分辨率高、易于實現(xiàn)自動化及互聯(lián)網(wǎng)海量數(shù)據(jù)共享等優(yōu)勢,自1997年最先被報道以來得到了廣泛的應用,成為環(huán)境微生物群落分析的最強有力的工具之一.本文詳細介紹了T-RFLP技術的原理,并從環(huán)境樣品群落DNA的提取、引物設計和PCR擴增、限制性酶切、電泳分離檢測和T-RFLP圖譜解析等5個方面討論了用該技術解析環(huán)境微生物群落的方法和技巧,簡述了近8 a來國外T-RFLP技術在群落分析中的研究進展.類似于其他的分子微生物生態(tài)學技術, T-RFLP也有自身的缺陷,因此重點分析了該技術的局限性及相應的解決辦法. 圖2 表1 參62

作 者： 余素林 吳曉磊 錢易 YU Sulin WU Xiaolei QIAN Yi   作者單位： 清華大學環(huán)境科學與工程系/環(huán)境模擬與污染控制國家重點聯(lián)合實驗室,北京,100084  刊 名： 應用與環(huán)境生物學報  ISTIC PKU 英文刊名： CHINESE JOURNAL OF APPLIED & ENVIRONMENTAL BIOLOGY  年，卷(期)： 2006 12(6)  分類號： Q93  關鍵詞： 微生物群落   末端限制性片段長度多態(tài)性分析(T-RFLP)   分子微生物生態(tài)學   生物多樣性  

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